近史所檔案館
近史所自籌備時起，首任所長郭廷以先生十分注重蒐集第一手的原始史料，在1955年即與外交部洽商接收清季總理各國事物衙門、外務部等珍貴檔案，1966年起又自經濟部接收清末至各國的各經濟部會檔案資料，為保存、整編這些資料，遂於1958年設立檔案館，而後於1988年完成新檔案館。
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近代史研究所檔案館
近史所檔案館
近史所檔案館除了接收外交部及經濟部等相關檔案之外，在1966年3月接收郭廷以圖書館的個人資料室之檔案；1999年3月，近史所院史資料室併入檔案館；日後又陸續接收個人及團體捐贈的資料，形成立一重要典藏。外交檔案亦有增加，1997和1999年分別獲得中華民國駐英及駐韓使館檔案，2007年復由外交部移轉製檔案館約6千冊案卷，代為保管。截至2012年，館藏檔案長度約14863公尺。
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