第一屆總統科學獎在台北圓山大飯店舉行頒獎典禮，本院宋瑞樓院士、林長壽院士及原分所研究員兼所長劉國平先生獲選為首屆得獎者。本獎項為李遠哲院長規劃推動促成，係中華民國政府辦給從事基礎科學研究者之最高榮譽，每兩年頒發一次，每次得獎者最多四人。
聘劉國平為原子與分子科學研究所代理所長（10月真除）；聘陸天堯為化學研究所所長。
2004年10月，劉翠溶副院長（中）主持原分所第三、四任所長交接典禮，右為卸任所長劉國平院士，左為新所長王玉麟所長。
