總辦事處及天文、氣象、地質、史語、社會等五所復員遷回南京，數學、物理、化學、動物、植物、醫學、心理、工學等研究所、處遷返上海原自然科學研究所大樓。
院務會議通過，聘魏喦壽為化學所籌備處主任（1965年4月成所），梁序穆為動物所籌備處主任，楊樹人為經濟所籌備處主任（楊氏以本院經費不足，暫緩經濟所籌備工作）。
夏，生物館（動物、植物研究所共用）落成啟用（位於今總辦事處後側，郵局旁）。為南港區 1961年以前各所所建「研究大樓」迄今碩果僅存者。
聘蘇仲卿為動物研究所籌備處主任。
聘蘇仲卿為動物所所長，兼任生化所籌備處主任（該所於1977年7月成所）。
聘張崑雄為動物研究所所長。
聘周延鑫為動物研究所所長。
聘邵廣昭為動物所研究所所長。
為推動水產生物技術、基因轉殖、生理生態，免疫和魚病防治等相關領域之科技研發工作，於1997年即定案在宜蘭縣礁溪鄉興建「臨海研究站」，基地由金車公司捐地1.1公頃，該研究站隸屬於動物所（細生所），在1999年6月16日舉行動土典禮。
動物所所長邵廣昭應中國科學院副院長陳宜諭院長之邀，赴廈門出席魚類學會議，並接受該院「國立中央研究院自然歷史博物館叢刊（Sinensia）」一套，內容以動植物系統分類為主，自1929年至1949年共20卷，極具學術研究參考價值。
