1929年1月在南京成賢街46號籌設自然歷史博物館，內分動物、植物二組。1930年1月正式成立，先後由錢天鶴及徐韋曼擔任主任。
1934年7月1日，自然歷史博物館改組，定名為動植物研究所，所長由王家楫先生擔任，所址遷至南京成賢街68號。在1944年5月，動植物研究所分為植物及動物研究所。
